En el municipio Banes predominan las llanuras y las elevaciones de poca altura. Las tierras del litoral son bastantes onduladas, debido a la abundancia de colinas y farallones de su lomerío, que pertenece al grupo orográfico de Maniabón. Este lomerío se halla compuesto por dos series de lomas, una sobre las costas y otra interior, constituyendo ambos grupos elevaciones de poca altura. El relieve del cabo presenta sus principales lomas en el litoral, bordeando toda costa, lo que contrasta con las pocas elevaciones que tiene el litoral.
El punto culminante lo conforma el Pan de Samá al noroeste del Municipio con una altura de 320 msnm, otras elevaciones importantes son la Sierra de Yagüajay con 129 m, cordillera La Cuchilla con 284 m, loma La Vigía con 337 m y Sierra de Mulas con 139 m. El aspecto general del terreno en este municipio es llano y ondulado, con algunas montañas en la costa. Es regado por los ríos Banes, Jagüeyes y Negro.
El río Banes que nace en la falda meridional de las lomas de Mulas y va a desembocar a la costa norte por la orilla del puerto de Banes. Entre sus alturas se destacan la sierra en el barrio Yaguajay, y el punto cumbre es el Pan de Samá que logra los 290 m de altura. El relieve con elevaciones, sabanas, valles y demás.